Lisansüstü Eğitim Enstitüsü

Akademik Kadro

Aslı KUTLU

Aslı Kutlu,  Dr. Öğr. Üyesi

CV

Aslı Kutlu completed her undergraduate studies in 2012 at the department of Chemical and Biological Engineering at Koç University. In 2012, she started her PhD at the department of Molecular Biology, Genetics and Bioengineering. Sabancı University, under the supervision of Prof. Uğur Sezerman. Her research studies are about the protein engineering application of cellulase and lipase enzymes from the perspective of both experimental and computation point of view. After receiving PhD at 2017, she works as post-doctoral fellow at Acıbadem Mehmet Aydınlar University, Department of Medical Statistics and Bioinformatics, School of Medicine, where she again joined to Sezerman Lab. During the post-doctoral fellowship, she mostly focused on the investigation of rare disease mechanism through molecular dynamics (MD) studies to elucidate the roles of novel mutations. In 2019 February, she started to work at Biruni University as Assistant Professor. Now, she has joined to İstinye University, the department of molecular biology and genetics. Still, her research studies are about the investigation of rare disease mechanism through MD studies and the identification of novel genes as potential biomarkers for Head-and-Neck cancer and Cholangiocarcinoma. Aslı Kutlu is the author of 6 articles and she is a principle investigator of TUBITAK-1002 project and a researcher in several BAP-projects.

Araştırma Alanları: Biyoinformatik, Protein Engineering, Protein Biochemistry, Bioinformatics Analysis, Medical Genetics, Molecular Genetics, Modeling and Simulation

Temel Alanları: Moleküler Biyoloji ve Genetik,  Biyoteknoloji,  Moleküler Biyoloji, 

Moleküler Biyoloji Güncel Araştırma Teknikleri
2022 - Türkçe, Bilimsel Kitap
ISBN: 978-625-7849-52-4
KUTLU ASLI
TÜM YÖNLERİYLE DİL VE KONUŞMA BOZUKLUKLARINDA DEĞERLENDİRME
2023 - Türkçe, Bilimsel Kitap
ISBN: 978-625-399-460-0
FIRTINA SİNEM, KUTLU ASLI
TNFRSF13B VARIANTS ACT AS MODIFIERS TO CLINICAL PHENOTYPES IN COMMON VARIABLE IMMUNE DEFICIENCY DISORDERS
2023 - Ulusal Hakemli
Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi / Journal of Advanced Research in Health Sciences, FIRTINA SİNEM, KUTLU ASLI, Işıkgil Begüm, yozlu medine nur, Cebeci Beyza Nur, Yılmaz Hülya, NG YUK YIN, HATIRNAZ NG ÖZDEN, KIYKIM AYÇA, YUCEL ESRA OZEK, AYDINER ELİF, BARIŞ SAFA, ÖZEN AHMET OĞUZHAN, NEPESOV SERDAR, CAMCIOĞLU YILDIZ, REİSLİ İSMAİL, AR MUHLİS CEM, SAYİTOĞLU MÜGE
Repurposing Fc gamma receptor I (FcγRI, CD64) for site-oriented monoclonal antibody capture: A proof-of-concept study for real-time detection of tumor necrosis factor-alpha (TNF -α)
2023 - Uluslararası Hakemli
Heliyon, ÇAPKIN EDA, KUTLU ASLI, YÜCE MERAL
Identification of key genes and pathways for cholangiocarcinoma using an integrated bioinformatics analysis
2022 - Ulusal Hakemli
International Journal of Medical Biochemistry, KUTLU ASLI, Arda Merve, Atak Evren, ULUKAYA ENGİN
Discussing the roles of proline and glycine from the perspective of cold adaptation in lipases and cellulases
2022 - Uluslararası Hakemli
Biocatalysis and Biotransformation, Öten Ahmet Melih, Atak Evren, TAKTAK KARACA BANU, FIRTINA SİNEM, KUTLU ASLI
Computational analysis of missense filamin-A variants, including the novel p.Arg484Gln variant of two brothers with periventricular nodular heterotopia.
2022 - Uluslararası Hakemli
PloS one, Gerlevik Umut, Saygı Ceren, CANGÜL HAKAN, KUTLU ASLI, Çaralan Erdal Fırat, TOPÇU YASEMİN, ÖZÖREN NESRİN, SEZERMAN OSMAN UĞUR
Identifying and elucidating the roles of Y198N and Y204F mutations in the PAH enzyme through molecular dynamic simulations
2021 - Uluslararası Hakemli
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Aslan Tolga, KUTLU ASLI, Gerlevik Umut, AKTUĞLU ZEYBEK AYŞE ÇİĞDEM, KIYKIM ERTUĞRUL, SEZERMAN OSMAN UĞUR, BİRGÜL NECLA
Performing the comparative analysis to understand the functional roles of genes in different pathways of cardiomyopathy disease
2021 - Uluslararası Hakemli
Meta Gene, Atak Evren, Karaoğlu Dilara, Serttürk Seda, KOYUNCU IRMAK DUYGU, KUTLU ASLI
Understanding the impacts of self-shuffling approach on structure and function of shuffled endoglucanase enzyme via MD simulations
2020 - Ulusal Hakemli
Turkish Journal of Biochemistry, YENENLER ASLI,Gerlevik Umut,sezerman osman uğur
Elucidating the roles of naturally occurring silent mutations in Polycystic Ovary Syndrome (PCOS)
2020 - Uluslararası Hakemli
Elsevier BV, Gümüşgül Meryem Dilara,Şahin Şuara,Turan Hatice Kübra,TAKTAK KARACA BANU,YENENLER ASLI
A possible founder mutation in FZD6 gene in a Turkish family with autosomal recessive nail dysplasia
2019 - Uluslararası Hakemli
BMC Medical Genetics, Saygı Ceren,ALANAY YASEMİN,SEZERMAN OSMAN UĞUR,YENENLER ASLI,ÖZÖREN NESRİN
Enhancing Enzymatic Properties of Endoglucanase I Enzyme from Trichoderma Reesei via Swapping from Cellobiohydrolase I Enzyme
2019 - Uluslararası Hakemli
CATALYSTS, YENENLER ASLI,KURT HASAN,sezerman osman uğur
Investigating the structural properties of the active conformation BTL2 of a lipase from Geobacillus thermocatenulatus in toluene using molecular dynamic simulations and engineering BTL2 via in-silico mutation
2018 - Uluslararası Hakemli
JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, YENENLER ASLI,sezerman osman uğur
Desing and characterization of two novel cellulases through single gene shuffling of Cel12A (EG3) gene from Trichoderma reesei
2016 - Uluslararası Hakemli
PROTEIN ENGINEERING DESIGN SELECTION, YENENLER ASLI,sezerman osman uğur
Yaygın Değişken İmmün Yetersizliklerde Tüm Genom Metilasyon Değişimlerinin İncelenmesi
2024 - Ulusal
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Biyoteknoloji>Moleküler Biyoloji>Biyoenformatik ,
Hydrogen Bond Fingerprints: Revealing the Complexities of Protein Function
2023 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Generation of novel cellulases and lipases for industrial applications through DNA shuffling and molecular dynamic simulations
Ulusal
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Biyoteknoloji>Enzim ve Mikrobiyal Biyoteknoloji>Genetik ,
“MASP2 geninde meydana gelen sessiz varyantların biyoinformatik analizi
2021 - Ulusal ISSN 2147-9488
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Genetik>Moleküler Biyoloji ,
Explaining the Different Forms of Primer Immunodeficiency (PID) Caused by Missense Variants in RAG1 Gene from Structural Perspective
2022 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
How To Use Big Data In Health Informatics For Discovery Of Diagnostics and Prognostic Biomarkers In Cancer?
2022 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
How To Utilize Gene Expression Omnibus (GEO) Data Sets In Pathway-Based Biomarker Studies: Cholangiocarcinoma Case
2022 - Ulusal ISSN 1303-829X
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Head and Neck cancer: performing functional gene enrichment and clustering study to discover the new potentials as biomarker
2020 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Moleküler Biyoloji ve Genetik ,
Database application on cardiomyopathy
2020 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı->Biyomedikal Mühendisliği ,
Using a decision tree meta-predictor and accelerated molecular dynamics method together to predict the functional impacts of variants
2020 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Biyoloji ,
Kolanjiokarsinomda secili genlerin potansiyel biyobelirtec rollerinin hesaplamali yaklasimla yeniden gozden gecirilmesi
Ulusal
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Probing for potential genes as novel biomarkers in head-and-neck cancer: prognostic and diagnostic approach
2022 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Probing The Structural Impacts Of Arg388 Replacements In Pkp2 Protein Complex: Spesıfıc Case In Arvc
2022 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Bioinformatics Approach Of The Effect Of Radıochemotherapy Treatment On Gene Expression
Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Revealing the structural impacts of point mutations on MeCP2 protein associated with Rett Syndrome via MD Simulations
2020 - Uluslararası ISSN -
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Head-and-neck cancer: performin functional gene enrichment and clustering study to discover the new potentials as biomarker
2021 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Genetik>Kanser biyolojisi ,
SCRAPIE RELATED MUTATIONSANALYSES OF SHEEP PRION PROTEIN VIA MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS
2020 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
Analysis of Cold-Adaptive Lipases with Molecular Dynamics Simulations
2020 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı>Biyomühendislik>Biyoteknoloji>Moleküler Genetik>Protein Mühendisliği ,
The investigation of activation mechanism of BTL2 in non-aqueous solvents
2014 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>İstatistik>Biyo-enformatik>İstatistiksel Analiz ,
Generation of cellulases for industrial applications through DNA shuffling
2015 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Enzim ve Mikrobiyal Biyoteknoloji>Biyoteknoloji>Moleküler Biyoloji ,
An attempt to improve the accuracy of mutation impact prediction through molecular dynamics studies
2019 - Uluslararası
Sağlık Bilimleri Temel Alanı>Tıbbi Biyoloji ,
An attempt to identify the potential biomarkers in the Bladder Cancer via functional gene-enrichment approach
2019 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Genetik>Moleküler Biyoloji ,
Head-and-neck cancer: Performing functional gene enrichment study to discover the new potentials as biomarkers
2019 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Genetik ,
Head-and-neck cancer: Performing functional gene enrichment study to discover the new potentials as biomarker
2019 - Uluslararası
Mühendislik Temel Alanı->Biyomedikal Mühendisliği ,
Gene enrichment analysis to elucidate the role of mitochondrial genes in prostate cancer
2019 - Uluslararası
Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Genetik>Moleküler Biyoloji ,